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长江大学许锋获国家专利权

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龙图腾网获悉长江大学申请的专利一种基于三代全长和二代转录组测序挖掘花椒叶片萜类化合物合成关键基因的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115295073B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-07-11发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202111021607.4,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权一种基于三代全长和二代转录组测序挖掘花椒叶片萜类化合物合成关键基因的方法是由许锋;刘晓梦;唐宁;陈泽雄;张威威;廖咏玲;叶家保;杨晓燕设计研发完成,并于2021-09-01向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于三代全长和二代转录组测序挖掘花椒叶片萜类化合物合成关键基因的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于三代全长和二代转录组测序挖掘花椒叶片萜类化合物合成关键基因的方法,包括:测定竹叶花椒与其芽变品种荣昌无刺花椒三个不同发育时期叶片中的萜类化合物的成分及含量;提取叶片的总RNA构建测序文库,数据分析并功能注释。预测了CDS、SSR、lncRNAs和As事件,分析差异表达基因并筛选与萜类化合物生物合成相关的结构基因与转录因子的差异表达基因;构建共表达基因网络,将hub基因的FPKM值与萜类化合物含量进行相关性分析,选取与萜类化合物含量正相关的基因作为其合成相关基因。本发明成功构建了花椒高质量的转录本,揭示了12个可能参与调节萜类化合物合成的关键基因,为解析花椒叶片萜类物质生物合成的分子机制奠定了基础。

本发明授权一种基于三代全长和二代转录组测序挖掘花椒叶片萜类化合物合成关键基因的方法在权利要求书中公布了:1.一种基于三代全长和二代转录组测序挖掘花椒叶片萜类化合物合成关键基因的方法,其特征在于,所述方法包括: 步骤1、测定了竹叶花椒和荣昌无刺花椒的三个不同发育时期,即幼叶、成熟叶和老叶中的萜类化合物的成分和含量,比较差异; 步骤2、分别提取竹叶花椒和荣昌无刺花椒的幼叶、成熟叶和老叶的总RNA,并提取竹叶花椒和荣昌无刺花椒幼叶、成熟叶和老叶时期混合样的总RNA,分别测序并构建全长转录组以及转录组数据集,获得原始数据; 步骤3、对步骤2获得的原始数据进行校正后得到高质量序列,将高质量序列过滤后得到干净数据,将所述干净数据进行组装处理,获得竹叶花椒与荣昌无刺花椒的全长转录组数据库和转录组数据库; 步骤4、对步骤3中得到的全长转录组数据库和转录组数据库进行可变剪接候选事件以及简单重复序列预测,并对可变剪接候选事件的真实性进行验证; 步骤5、对步骤3中得到的全长转录组数据库和转录组数据库进行转录本序列的编码区序列以及lncRNAs预测; 步骤6、对步骤3中的转录组数据库中的基因,进行功能注释以及转录因子的预测,鉴定样本之间的差异表达基因,并根据功能注释以及差异基因信息筛选与萜类化合物合成相关的酶基因以及转录因子; 步骤7、对步骤5中的lncRNAs的靶基因进行预测,根据lncRNAs靶基因预测信息对步骤6中筛选得到的基因的lncRNAs进行调控网络分析; 步骤8、对步骤6中的基因进行加权基因共表达网络分析,并通过可视化网络构建基因调控网络图,筛选得到与萜类代谢高连通性的hub基因; 步骤9、对步骤1中的显著差异的萜类化合物以及步骤8中的hub基因进行相关性分析,选择其中与萜类化合物含量具有相关性的基因,作为萜类化合物合成的关键基因。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人长江大学,其通讯地址为:434023 湖北省荆州市南环路1号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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